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一个健康的男性行精液检查，精子的畸形率不会高于30%；而当畸形率在50%以上时称为高畸形率精子症；畸形精子是指头、体、尾的形态变异，头部畸形有巨大头、无定形、双头、小头精子等；体部畸形有体部粗大、折裂、不完整等； 尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。
引起高畸形率精子症的原因：
一、多见于泌尿生殖道感染(如：支原体、衣原体、淋菌、G+球菌、G-杆菌等)、先天性睾丸发育不全、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、慢性中毒、营养不良、精神过度紧张、性交过频、精索静脉曲张等;以上疾病均可影响精子的发生过程；
二、使用激素或某些化学药物，如地糖皮质激素类长期服用、抗癌药、利血平、马利兰、呋喃类等对精原细胞的分裂和精子成熟亦有干扰作用，也会导致精子畸形；
三、生殖器官，如：睾丸、附睾、精囊腺受到放射线照射，可引起精子发生突变。精细胞突变与照射强度、照射时间有关；
四、阴囊局部长期高热、长期酗酒(高浓度的烈性酒)，均可使精子发生畸变。酗酒和长期饮用酒精含量较高的烈性酒，可以损害睾丸生精细胞功能、干扰精子生长成熟，使精子畸形；
五、若畸形精子超过70%，则患者很可能存在染色体病，这时应进行染色体检查，染色体病治疗难度较大。
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